Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LDB2O43679 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LDB2O43679 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LDB2O43679 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LDB2O43679 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LDB2O43679 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LDB2O43679 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LDB2O43679 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LDB2O43679 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LDB2O43679 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LDB2O43679 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LDB2O43679 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LDB2O43679 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LDB2O43679 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LDB2O43679 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LDB2O43679 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LDB2O43679 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LDB2O43679 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LDB2O43679 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LDB2O43679 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LDB2O43679 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LDB2O43679 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LDB2O43679 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDB2O43679 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDB2O43679 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LDB2O43679 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LDB2O43679 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LDB2O43679 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LDB2O43679 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LDB2O43679 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LDB2O43679 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LDB2O43679 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LDB2O43679 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LDB2O43679 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LDB2O43679 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LDB2O43679 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LDB2O43679 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LDB2O43679 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LDB2O43679 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LDB2O43679 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LDB2O43679 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LDB2O43679 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LDB2O43679 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LDB2O43679 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LDB2O43679 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LDB2O43679 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LDB2O43679 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LDB2O43679 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LDB2O43679 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LDB2O43679 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LDB2O43679 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LDB2O43679 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LDB2O43679 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LDB2O43679 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LDB2O43679 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LDB2O43679 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LDB2O43679 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LDB2O43679 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LDB2O43679 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LDB2O43679 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LDB2O43679 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LDB2O43679 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LDB2O43679 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LDB2O43679 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LDB2O43679 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LDB2O43679 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LDB2O43679 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LDB2O43679 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LDB2O43679 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LDB2O43679 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LDB2O43679 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LDB2O43679 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LDB2O43679 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LDB2O43679 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LDB2O43679 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LDB2O43679 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LDB2O43679 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LDB2O43679 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LDB2O43679 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LDB2O43679 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LDB2O43679 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LDB2O43679 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LDB2O43679 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LDB2O43679 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LDB2O43679 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LDB2O43679 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LDB2O43679 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LDB2O43679 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LDB2O43679 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LDB2O43679 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LDB2O43679 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LDB2O43679 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LDB2O43679 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LDB2O43679 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LDB2O43679 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LDB2O43679 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LDB2O43679 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LDB2O43679 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LDB2O43679 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LDB2O43679 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms