Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TIMM44O43615 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TIMM44O43615 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
TIMM44O43615 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TIMM44O43615 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TIMM44O43615 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TIMM44O43615 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TIMM44O43615 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TIMM44O43615 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TIMM44O43615 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TIMM44O43615 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TIMM44O43615 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TIMM44O43615 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TIMM44O43615 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TIMM44O43615 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TIMM44O43615 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TIMM44O43615 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TIMM44O43615 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TIMM44O43615 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TIMM44O43615 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TIMM44O43615 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TIMM44O43615 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TIMM44O43615 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TIMM44O43615 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TIMM44O43615 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TIMM44O43615 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TIMM44O43615 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TIMM44O43615 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TIMM44O43615 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TIMM44O43615 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TIMM44O43615 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TIMM44O43615 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TIMM44O43615 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TIMM44O43615 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TIMM44O43615 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TIMM44O43615 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TIMM44O43615 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TIMM44O43615 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TIMM44O43615 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TIMM44O43615 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TIMM44O43615 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TIMM44O43615 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TIMM44O43615 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TIMM44O43615 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TIMM44O43615 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TIMM44O43615 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TIMM44O43615 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TIMM44O43615 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TIMM44O43615 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TIMM44O43615 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TIMM44O43615 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TIMM44O43615 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TIMM44O43615 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TIMM44O43615 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TIMM44O43615 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TIMM44O43615 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TIMM44O43615 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TIMM44O43615 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TIMM44O43615 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TIMM44O43615 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TIMM44O43615 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TIMM44O43615 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TIMM44O43615 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TIMM44O43615 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TIMM44O43615 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TIMM44O43615 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TIMM44O43615 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TIMM44O43615 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TIMM44O43615 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TIMM44O43615 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TIMM44O43615 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TIMM44O43615 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TIMM44O43615 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TIMM44O43615 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TIMM44O43615 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TIMM44O43615 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TIMM44O43615 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TIMM44O43615 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TIMM44O43615 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TIMM44O43615 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TIMM44O43615 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TIMM44O43615 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TIMM44O43615 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TIMM44O43615 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TIMM44O43615 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TIMM44O43615 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TIMM44O43615 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TIMM44O43615 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TIMM44O43615 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TIMM44O43615 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TIMM44O43615 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TIMM44O43615 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TIMM44O43615 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TIMM44O43615 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TIMM44O43615 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TIMM44O43615 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TIMM44O43615 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TIMM44O43615 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TIMM44O43615 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TIMM44O43615 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms