Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRXO43186 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CRXO43186 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CRXO43186 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CRXO43186 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CRXO43186 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CRXO43186 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CRXO43186 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CRXO43186 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CRXO43186 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CRXO43186 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CRXO43186 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CRXO43186 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CRXO43186 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CRXO43186 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRXO43186 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRXO43186 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CRXO43186 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRXO43186 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRXO43186 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRXO43186 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRXO43186 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRXO43186 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRXO43186 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRXO43186 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRXO43186 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRXO43186 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRXO43186 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRXO43186 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRXO43186 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRXO43186 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRXO43186 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRXO43186 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRXO43186 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CRXO43186 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CRXO43186 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CRXO43186 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CRXO43186 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CRXO43186 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CRXO43186 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CRXO43186 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CRXO43186 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRXO43186 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRXO43186 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRXO43186 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRXO43186 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CRXO43186 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRXO43186 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRXO43186 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRXO43186 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRXO43186 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CRXO43186 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRXO43186 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRXO43186 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRXO43186 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRXO43186 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRXO43186 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRXO43186 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRXO43186 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRXO43186 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRXO43186 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CRXO43186 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRXO43186 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRXO43186 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRXO43186 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRXO43186 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CRXO43186 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CRXO43186 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CRXO43186 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CRXO43186 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CRXO43186 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CRXO43186 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CRXO43186 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CRXO43186 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CRXO43186 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CRXO43186 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CRXO43186 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CRXO43186 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CRXO43186 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CRXO43186 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CRXO43186 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CRXO43186 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CRXO43186 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CRXO43186 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CRXO43186 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CRXO43186 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CRXO43186 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRXO43186 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRXO43186 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRXO43186 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRXO43186 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRXO43186 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRXO43186 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRXO43186 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRXO43186 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRXO43186 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRXO43186 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRXO43186 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRXO43186 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CRXO43186 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms