Protein–RNA interactions for Protein: O15270

SPTLC2, Serine palmitoyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC2O15270 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPTLC2O15270 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SPTLC2O15270 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPTLC2O15270 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPTLC2O15270 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPTLC2O15270 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPTLC2O15270 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPTLC2O15270 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPTLC2O15270 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPTLC2O15270 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPTLC2O15270 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPTLC2O15270 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPTLC2O15270 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPTLC2O15270 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPTLC2O15270 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPTLC2O15270 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPTLC2O15270 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPTLC2O15270 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPTLC2O15270 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPTLC2O15270 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPTLC2O15270 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPTLC2O15270 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SPTLC2O15270 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SPTLC2O15270 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SPTLC2O15270 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SPTLC2O15270 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SPTLC2O15270 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPTLC2O15270 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPTLC2O15270 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SPTLC2O15270 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SPTLC2O15270 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SPTLC2O15270 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SPTLC2O15270 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SPTLC2O15270 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SPTLC2O15270 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SPTLC2O15270 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SPTLC2O15270 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPTLC2O15270 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPTLC2O15270 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPTLC2O15270 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPTLC2O15270 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPTLC2O15270 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SPTLC2O15270 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SPTLC2O15270 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SPTLC2O15270 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SPTLC2O15270 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SPTLC2O15270 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPTLC2O15270 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPTLC2O15270 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPTLC2O15270 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPTLC2O15270 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPTLC2O15270 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPTLC2O15270 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPTLC2O15270 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPTLC2O15270 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPTLC2O15270 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPTLC2O15270 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPTLC2O15270 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPTLC2O15270 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPTLC2O15270 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPTLC2O15270 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SPTLC2O15270 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPTLC2O15270 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPTLC2O15270 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SPTLC2O15270 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPTLC2O15270 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPTLC2O15270 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPTLC2O15270 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPTLC2O15270 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPTLC2O15270 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPTLC2O15270 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPTLC2O15270 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPTLC2O15270 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SPTLC2O15270 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPTLC2O15270 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPTLC2O15270 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPTLC2O15270 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPTLC2O15270 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SPTLC2O15270 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPTLC2O15270 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPTLC2O15270 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPTLC2O15270 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPTLC2O15270 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPTLC2O15270 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPTLC2O15270 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPTLC2O15270 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPTLC2O15270 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SPTLC2O15270 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPTLC2O15270 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPTLC2O15270 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPTLC2O15270 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPTLC2O15270 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SPTLC2O15270 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SPTLC2O15270 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SPTLC2O15270 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPTLC2O15270 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPTLC2O15270 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPTLC2O15270 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SPTLC2O15270 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPTLC2O15270 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms