Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARPC1BO15143 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARPC1BO15143 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARPC1BO15143 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARPC1BO15143 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARPC1BO15143 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARPC1BO15143 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARPC1BO15143 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARPC1BO15143 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARPC1BO15143 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARPC1BO15143 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARPC1BO15143 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARPC1BO15143 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARPC1BO15143 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARPC1BO15143 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARPC1BO15143 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARPC1BO15143 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARPC1BO15143 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARPC1BO15143 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARPC1BO15143 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARPC1BO15143 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARPC1BO15143 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARPC1BO15143 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARPC1BO15143 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARPC1BO15143 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARPC1BO15143 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARPC1BO15143 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARPC1BO15143 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARPC1BO15143 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARPC1BO15143 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARPC1BO15143 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARPC1BO15143 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARPC1BO15143 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARPC1BO15143 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARPC1BO15143 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARPC1BO15143 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARPC1BO15143 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARPC1BO15143 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARPC1BO15143 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARPC1BO15143 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARPC1BO15143 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARPC1BO15143 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARPC1BO15143 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARPC1BO15143 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARPC1BO15143 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARPC1BO15143 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARPC1BO15143 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARPC1BO15143 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARPC1BO15143 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARPC1BO15143 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARPC1BO15143 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARPC1BO15143 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARPC1BO15143 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARPC1BO15143 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARPC1BO15143 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARPC1BO15143 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARPC1BO15143 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARPC1BO15143 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARPC1BO15143 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARPC1BO15143 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARPC1BO15143 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ARPC1BO15143 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ARPC1BO15143 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARPC1BO15143 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARPC1BO15143 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARPC1BO15143 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARPC1BO15143 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARPC1BO15143 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARPC1BO15143 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARPC1BO15143 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARPC1BO15143 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARPC1BO15143 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARPC1BO15143 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARPC1BO15143 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARPC1BO15143 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ARPC1BO15143 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARPC1BO15143 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARPC1BO15143 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARPC1BO15143 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARPC1BO15143 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARPC1BO15143 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARPC1BO15143 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARPC1BO15143 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARPC1BO15143 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARPC1BO15143 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARPC1BO15143 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARPC1BO15143 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARPC1BO15143 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARPC1BO15143 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ARPC1BO15143 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARPC1BO15143 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARPC1BO15143 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARPC1BO15143 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARPC1BO15143 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARPC1BO15143 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARPC1BO15143 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARPC1BO15143 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARPC1BO15143 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARPC1BO15143 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARPC1BO15143 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms