Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SETD1AO15047 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SETD1AO15047 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SETD1AO15047 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
SETD1AO15047 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SETD1AO15047 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SETD1AO15047 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SETD1AO15047 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SETD1AO15047 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SETD1AO15047 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
SETD1AO15047 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
SETD1AO15047 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
SETD1AO15047 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SETD1AO15047 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SETD1AO15047 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
SETD1AO15047 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
SETD1AO15047 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SETD1AO15047 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SETD1AO15047 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SETD1AO15047 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
SETD1AO15047 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SETD1AO15047 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SETD1AO15047 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SETD1AO15047 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
SETD1AO15047 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SETD1AO15047 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SETD1AO15047 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SETD1AO15047 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SETD1AO15047 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SETD1AO15047 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SETD1AO15047 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SETD1AO15047 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SETD1AO15047 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SETD1AO15047 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SETD1AO15047 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SETD1AO15047 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SETD1AO15047 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SETD1AO15047 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SETD1AO15047 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SETD1AO15047 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SETD1AO15047 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SETD1AO15047 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SETD1AO15047 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SETD1AO15047 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SETD1AO15047 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
SETD1AO15047 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
SETD1AO15047 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SETD1AO15047 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SETD1AO15047 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.46
SETD1AO15047 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SETD1AO15047 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SETD1AO15047 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SETD1AO15047 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SETD1AO15047 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SETD1AO15047 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SETD1AO15047 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SETD1AO15047 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SETD1AO15047 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SETD1AO15047 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
SETD1AO15047 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SETD1AO15047 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SETD1AO15047 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SETD1AO15047 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SETD1AO15047 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SETD1AO15047 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SETD1AO15047 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
SETD1AO15047 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
SETD1AO15047 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SETD1AO15047 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SETD1AO15047 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SETD1AO15047 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SETD1AO15047 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SETD1AO15047 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SETD1AO15047 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SETD1AO15047 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SETD1AO15047 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SETD1AO15047 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SETD1AO15047 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SETD1AO15047 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SETD1AO15047 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SETD1AO15047 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SETD1AO15047 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SETD1AO15047 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
SETD1AO15047 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
SETD1AO15047 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SETD1AO15047 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SETD1AO15047 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SETD1AO15047 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SETD1AO15047 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SETD1AO15047 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SETD1AO15047 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SETD1AO15047 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SETD1AO15047 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SETD1AO15047 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SETD1AO15047 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
SETD1AO15047 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SETD1AO15047 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SETD1AO15047 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
SETD1AO15047 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
SETD1AO15047 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms