Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF3FO00303 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF3FO00303 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF3FO00303 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF3FO00303 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF3FO00303 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF3FO00303 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF3FO00303 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EIF3FO00303 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF3FO00303 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EIF3FO00303 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EIF3FO00303 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3FO00303 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3FO00303 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3FO00303 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3FO00303 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3FO00303 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3FO00303 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EIF3FO00303 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3FO00303 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3FO00303 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EIF3FO00303 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF3FO00303 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF3FO00303 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF3FO00303 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF3FO00303 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF3FO00303 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF3FO00303 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF3FO00303 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF3FO00303 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF3FO00303 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF3FO00303 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF3FO00303 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF3FO00303 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF3FO00303 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF3FO00303 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF3FO00303 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF3FO00303 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF3FO00303 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF3FO00303 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF3FO00303 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF3FO00303 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF3FO00303 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF3FO00303 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF3FO00303 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF3FO00303 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF3FO00303 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF3FO00303 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF3FO00303 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF3FO00303 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF3FO00303 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF3FO00303 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF3FO00303 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF3FO00303 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF3FO00303 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF3FO00303 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF3FO00303 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF3FO00303 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF3FO00303 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF3FO00303 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF3FO00303 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF3FO00303 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF3FO00303 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF3FO00303 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF3FO00303 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF3FO00303 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF3FO00303 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF3FO00303 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF3FO00303 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF3FO00303 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF3FO00303 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF3FO00303 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF3FO00303 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3FO00303 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF3FO00303 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF3FO00303 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF3FO00303 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3FO00303 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3FO00303 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3FO00303 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3FO00303 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3FO00303 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3FO00303 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3FO00303 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3FO00303 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF3FO00303 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF3FO00303 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF3FO00303 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF3FO00303 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF3FO00303 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF3FO00303 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF3FO00303 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF3FO00303 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF3FO00303 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF3FO00303 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF3FO00303 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF3FO00303 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF3FO00303 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF3FO00303 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF3FO00303 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms