Protein–RNA interactions for Protein: H3BNC9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNC9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
H3BNC9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
H3BNC9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
H3BNC9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
H3BNC9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
H3BNC9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
H3BNC9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
H3BNC9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
H3BNC9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
H3BNC9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
H3BNC9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
H3BNC9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
H3BNC9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
H3BNC9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
H3BNC9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
H3BNC9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
H3BNC9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
H3BNC9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
H3BNC9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
H3BNC9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
H3BNC9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
H3BNC9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
H3BNC9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
H3BNC9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
H3BNC9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
H3BNC9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
H3BNC9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
H3BNC9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
H3BNC9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
H3BNC9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
H3BNC9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
H3BNC9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
H3BNC9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
H3BNC9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
H3BNC9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
H3BNC9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
H3BNC9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
H3BNC9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
H3BNC9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
H3BNC9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
H3BNC9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
H3BNC9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
H3BNC9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
H3BNC9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
H3BNC9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
H3BNC9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
H3BNC9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
H3BNC9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
H3BNC9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
H3BNC9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
H3BNC9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
H3BNC9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
H3BNC9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
H3BNC9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
H3BNC9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
H3BNC9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
H3BNC9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
H3BNC9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
H3BNC9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
H3BNC9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
H3BNC9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
H3BNC9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
H3BNC9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
H3BNC9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
H3BNC9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
H3BNC9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
H3BNC9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
H3BNC9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.54■■■□□ 2
H3BNC9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.54■■■□□ 2
H3BNC9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
H3BNC9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
H3BNC9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
H3BNC9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
H3BNC9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
H3BNC9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
H3BNC9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
H3BNC9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
H3BNC9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
H3BNC9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
H3BNC9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.52■■■□□ 2
H3BNC9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
H3BNC9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
H3BNC9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
H3BNC9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
H3BNC9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
H3BNC9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
H3BNC9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
H3BNC9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
H3BNC9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
H3BNC9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
H3BNC9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
H3BNC9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
H3BNC9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
H3BNC9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
H3BNC9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
H3BNC9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
H3BNC9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
H3BNC9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
H3BNC9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
H3BNC9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms