Protein–RNA interactions for Protein: B7Z1M9

C2CD4D, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4D, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD4DB7Z1M9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C2CD4DB7Z1M9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
C2CD4DB7Z1M9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C2CD4DB7Z1M9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C2CD4DB7Z1M9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C2CD4DB7Z1M9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C2CD4DB7Z1M9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C2CD4DB7Z1M9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C2CD4DB7Z1M9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C2CD4DB7Z1M9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C2CD4DB7Z1M9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C2CD4DB7Z1M9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
C2CD4DB7Z1M9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C2CD4DB7Z1M9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
C2CD4DB7Z1M9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C2CD4DB7Z1M9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C2CD4DB7Z1M9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C2CD4DB7Z1M9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C2CD4DB7Z1M9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C2CD4DB7Z1M9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C2CD4DB7Z1M9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C2CD4DB7Z1M9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C2CD4DB7Z1M9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C2CD4DB7Z1M9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C2CD4DB7Z1M9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C2CD4DB7Z1M9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C2CD4DB7Z1M9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C2CD4DB7Z1M9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
C2CD4DB7Z1M9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C2CD4DB7Z1M9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
C2CD4DB7Z1M9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
C2CD4DB7Z1M9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C2CD4DB7Z1M9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
C2CD4DB7Z1M9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C2CD4DB7Z1M9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C2CD4DB7Z1M9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C2CD4DB7Z1M9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C2CD4DB7Z1M9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
C2CD4DB7Z1M9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
C2CD4DB7Z1M9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C2CD4DB7Z1M9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C2CD4DB7Z1M9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C2CD4DB7Z1M9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C2CD4DB7Z1M9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C2CD4DB7Z1M9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C2CD4DB7Z1M9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
C2CD4DB7Z1M9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C2CD4DB7Z1M9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C2CD4DB7Z1M9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C2CD4DB7Z1M9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
C2CD4DB7Z1M9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
C2CD4DB7Z1M9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C2CD4DB7Z1M9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
C2CD4DB7Z1M9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C2CD4DB7Z1M9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C2CD4DB7Z1M9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C2CD4DB7Z1M9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C2CD4DB7Z1M9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C2CD4DB7Z1M9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
C2CD4DB7Z1M9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
C2CD4DB7Z1M9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C2CD4DB7Z1M9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
C2CD4DB7Z1M9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C2CD4DB7Z1M9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C2CD4DB7Z1M9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C2CD4DB7Z1M9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
C2CD4DB7Z1M9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C2CD4DB7Z1M9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C2CD4DB7Z1M9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C2CD4DB7Z1M9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C2CD4DB7Z1M9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C2CD4DB7Z1M9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C2CD4DB7Z1M9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C2CD4DB7Z1M9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C2CD4DB7Z1M9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
C2CD4DB7Z1M9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C2CD4DB7Z1M9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C2CD4DB7Z1M9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C2CD4DB7Z1M9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
C2CD4DB7Z1M9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
C2CD4DB7Z1M9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C2CD4DB7Z1M9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C2CD4DB7Z1M9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C2CD4DB7Z1M9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
C2CD4DB7Z1M9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C2CD4DB7Z1M9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C2CD4DB7Z1M9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
C2CD4DB7Z1M9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
C2CD4DB7Z1M9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C2CD4DB7Z1M9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C2CD4DB7Z1M9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C2CD4DB7Z1M9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
C2CD4DB7Z1M9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
C2CD4DB7Z1M9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
C2CD4DB7Z1M9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
C2CD4DB7Z1M9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
C2CD4DB7Z1M9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
C2CD4DB7Z1M9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
C2CD4DB7Z1M9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
C2CD4DB7Z1M9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms