Protein–RNA interactions for Protein: A8MUI8

Putative UPF0607 protein ENSP00000383783, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MUI8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A8MUI8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A8MUI8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A8MUI8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A8MUI8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A8MUI8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A8MUI8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A8MUI8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A8MUI8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
A8MUI8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
A8MUI8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A8MUI8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A8MUI8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A8MUI8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A8MUI8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A8MUI8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A8MUI8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A8MUI8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A8MUI8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A8MUI8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A8MUI8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A8MUI8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A8MUI8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A8MUI8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A8MUI8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A8MUI8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A8MUI8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A8MUI8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A8MUI8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
A8MUI8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A8MUI8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A8MUI8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A8MUI8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A8MUI8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
A8MUI8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A8MUI8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A8MUI8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A8MUI8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A8MUI8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A8MUI8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A8MUI8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A8MUI8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A8MUI8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A8MUI8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A8MUI8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A8MUI8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A8MUI8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A8MUI8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A8MUI8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A8MUI8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A8MUI8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
A8MUI8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
A8MUI8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
A8MUI8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
A8MUI8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
A8MUI8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
A8MUI8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A8MUI8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
A8MUI8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
A8MUI8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
A8MUI8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A8MUI8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A8MUI8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
A8MUI8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A8MUI8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
A8MUI8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
A8MUI8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A8MUI8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A8MUI8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A8MUI8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
A8MUI8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A8MUI8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A8MUI8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
A8MUI8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A8MUI8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A8MUI8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A8MUI8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A8MUI8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
A8MUI8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
A8MUI8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A8MUI8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A8MUI8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A8MUI8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A8MUI8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A8MUI8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A8MUI8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A8MUI8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A8MUI8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A8MUI8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A8MUI8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A8MUI8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A8MUI8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A8MUI8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A8MUI8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A8MUI8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A8MUI8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A8MUI8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
A8MUI8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
A8MUI8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
A8MUI8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms