Protein–RNA interactions for Protein: A8MPX8

PP2D1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PP2D1A8MPX8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PP2D1A8MPX8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PP2D1A8MPX8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PP2D1A8MPX8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PP2D1A8MPX8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PP2D1A8MPX8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PP2D1A8MPX8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PP2D1A8MPX8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PP2D1A8MPX8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PP2D1A8MPX8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PP2D1A8MPX8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PP2D1A8MPX8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PP2D1A8MPX8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PP2D1A8MPX8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PP2D1A8MPX8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PP2D1A8MPX8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PP2D1A8MPX8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PP2D1A8MPX8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PP2D1A8MPX8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PP2D1A8MPX8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PP2D1A8MPX8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PP2D1A8MPX8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PP2D1A8MPX8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PP2D1A8MPX8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PP2D1A8MPX8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PP2D1A8MPX8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PP2D1A8MPX8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PP2D1A8MPX8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PP2D1A8MPX8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PP2D1A8MPX8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PP2D1A8MPX8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PP2D1A8MPX8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PP2D1A8MPX8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PP2D1A8MPX8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PP2D1A8MPX8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PP2D1A8MPX8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PP2D1A8MPX8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PP2D1A8MPX8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PP2D1A8MPX8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PP2D1A8MPX8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PP2D1A8MPX8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PP2D1A8MPX8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PP2D1A8MPX8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PP2D1A8MPX8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PP2D1A8MPX8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PP2D1A8MPX8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PP2D1A8MPX8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PP2D1A8MPX8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PP2D1A8MPX8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PP2D1A8MPX8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PP2D1A8MPX8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PP2D1A8MPX8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PP2D1A8MPX8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PP2D1A8MPX8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PP2D1A8MPX8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PP2D1A8MPX8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PP2D1A8MPX8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PP2D1A8MPX8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PP2D1A8MPX8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PP2D1A8MPX8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PP2D1A8MPX8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PP2D1A8MPX8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PP2D1A8MPX8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PP2D1A8MPX8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PP2D1A8MPX8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PP2D1A8MPX8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PP2D1A8MPX8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PP2D1A8MPX8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PP2D1A8MPX8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PP2D1A8MPX8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PP2D1A8MPX8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PP2D1A8MPX8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PP2D1A8MPX8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PP2D1A8MPX8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PP2D1A8MPX8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PP2D1A8MPX8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PP2D1A8MPX8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PP2D1A8MPX8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PP2D1A8MPX8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PP2D1A8MPX8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PP2D1A8MPX8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PP2D1A8MPX8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PP2D1A8MPX8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PP2D1A8MPX8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PP2D1A8MPX8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PP2D1A8MPX8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PP2D1A8MPX8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PP2D1A8MPX8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PP2D1A8MPX8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PP2D1A8MPX8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PP2D1A8MPX8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PP2D1A8MPX8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PP2D1A8MPX8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PP2D1A8MPX8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PP2D1A8MPX8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PP2D1A8MPX8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PP2D1A8MPX8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PP2D1A8MPX8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PP2D1A8MPX8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PP2D1A8MPX8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms