Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MEIS3P2A8K0S8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MEIS3P2A8K0S8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MEIS3P2A8K0S8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MEIS3P2A8K0S8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MEIS3P2A8K0S8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MEIS3P2A8K0S8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MEIS3P2A8K0S8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MEIS3P2A8K0S8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MEIS3P2A8K0S8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MEIS3P2A8K0S8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MEIS3P2A8K0S8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MEIS3P2A8K0S8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MEIS3P2A8K0S8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MEIS3P2A8K0S8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
MEIS3P2A8K0S8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MEIS3P2A8K0S8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MEIS3P2A8K0S8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MEIS3P2A8K0S8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MEIS3P2A8K0S8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MEIS3P2A8K0S8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MEIS3P2A8K0S8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MEIS3P2A8K0S8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MEIS3P2A8K0S8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MEIS3P2A8K0S8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MEIS3P2A8K0S8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MEIS3P2A8K0S8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MEIS3P2A8K0S8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MEIS3P2A8K0S8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MEIS3P2A8K0S8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MEIS3P2A8K0S8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MEIS3P2A8K0S8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MEIS3P2A8K0S8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MEIS3P2A8K0S8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MEIS3P2A8K0S8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MEIS3P2A8K0S8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MEIS3P2A8K0S8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MEIS3P2A8K0S8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MEIS3P2A8K0S8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MEIS3P2A8K0S8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MEIS3P2A8K0S8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MEIS3P2A8K0S8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MEIS3P2A8K0S8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MEIS3P2A8K0S8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MEIS3P2A8K0S8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MEIS3P2A8K0S8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MEIS3P2A8K0S8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MEIS3P2A8K0S8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MEIS3P2A8K0S8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MEIS3P2A8K0S8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MEIS3P2A8K0S8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MEIS3P2A8K0S8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MEIS3P2A8K0S8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MEIS3P2A8K0S8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MEIS3P2A8K0S8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MEIS3P2A8K0S8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MEIS3P2A8K0S8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MEIS3P2A8K0S8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MEIS3P2A8K0S8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MEIS3P2A8K0S8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MEIS3P2A8K0S8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MEIS3P2A8K0S8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MEIS3P2A8K0S8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MEIS3P2A8K0S8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MEIS3P2A8K0S8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MEIS3P2A8K0S8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MEIS3P2A8K0S8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MEIS3P2A8K0S8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MEIS3P2A8K0S8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MEIS3P2A8K0S8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MEIS3P2A8K0S8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MEIS3P2A8K0S8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MEIS3P2A8K0S8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MEIS3P2A8K0S8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MEIS3P2A8K0S8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MEIS3P2A8K0S8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MEIS3P2A8K0S8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MEIS3P2A8K0S8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MEIS3P2A8K0S8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MEIS3P2A8K0S8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MEIS3P2A8K0S8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MEIS3P2A8K0S8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MEIS3P2A8K0S8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MEIS3P2A8K0S8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MEIS3P2A8K0S8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MEIS3P2A8K0S8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MEIS3P2A8K0S8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MEIS3P2A8K0S8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MEIS3P2A8K0S8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MEIS3P2A8K0S8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MEIS3P2A8K0S8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MEIS3P2A8K0S8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MEIS3P2A8K0S8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MEIS3P2A8K0S8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MEIS3P2A8K0S8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MEIS3P2A8K0S8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MEIS3P2A8K0S8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MEIS3P2A8K0S8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MEIS3P2A8K0S8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MEIS3P2A8K0S8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms