Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCNX2A6NKB5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PCNX2A6NKB5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PCNX2A6NKB5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCNX2A6NKB5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCNX2A6NKB5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCNX2A6NKB5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCNX2A6NKB5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCNX2A6NKB5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCNX2A6NKB5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCNX2A6NKB5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCNX2A6NKB5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PCNX2A6NKB5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCNX2A6NKB5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCNX2A6NKB5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNX2A6NKB5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNX2A6NKB5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNX2A6NKB5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNX2A6NKB5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNX2A6NKB5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNX2A6NKB5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNX2A6NKB5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PCNX2A6NKB5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCNX2A6NKB5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCNX2A6NKB5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PCNX2A6NKB5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCNX2A6NKB5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCNX2A6NKB5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCNX2A6NKB5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCNX2A6NKB5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCNX2A6NKB5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCNX2A6NKB5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCNX2A6NKB5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PCNX2A6NKB5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCNX2A6NKB5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCNX2A6NKB5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCNX2A6NKB5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCNX2A6NKB5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCNX2A6NKB5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCNX2A6NKB5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCNX2A6NKB5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCNX2A6NKB5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCNX2A6NKB5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCNX2A6NKB5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCNX2A6NKB5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PCNX2A6NKB5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCNX2A6NKB5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCNX2A6NKB5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCNX2A6NKB5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCNX2A6NKB5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCNX2A6NKB5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PCNX2A6NKB5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCNX2A6NKB5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCNX2A6NKB5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PCNX2A6NKB5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCNX2A6NKB5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PCNX2A6NKB5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCNX2A6NKB5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCNX2A6NKB5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCNX2A6NKB5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCNX2A6NKB5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCNX2A6NKB5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNX2A6NKB5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNX2A6NKB5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNX2A6NKB5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNX2A6NKB5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNX2A6NKB5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCNX2A6NKB5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCNX2A6NKB5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCNX2A6NKB5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCNX2A6NKB5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCNX2A6NKB5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCNX2A6NKB5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCNX2A6NKB5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCNX2A6NKB5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCNX2A6NKB5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCNX2A6NKB5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCNX2A6NKB5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCNX2A6NKB5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCNX2A6NKB5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PCNX2A6NKB5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCNX2A6NKB5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCNX2A6NKB5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PCNX2A6NKB5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PCNX2A6NKB5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PCNX2A6NKB5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCNX2A6NKB5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCNX2A6NKB5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCNX2A6NKB5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCNX2A6NKB5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCNX2A6NKB5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCNX2A6NKB5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCNX2A6NKB5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCNX2A6NKB5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCNX2A6NKB5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCNX2A6NKB5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCNX2A6NKB5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCNX2A6NKB5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCNX2A6NKB5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCNX2A6NKB5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms