Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF25A6NGN4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF25A6NGN4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF25A6NGN4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF25A6NGN4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF25A6NGN4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF25A6NGN4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF25A6NGN4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF25A6NGN4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF25A6NGN4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF25A6NGN4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF25A6NGN4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF25A6NGN4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF25A6NGN4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF25A6NGN4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF25A6NGN4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF25A6NGN4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF25A6NGN4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF25A6NGN4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF25A6NGN4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF25A6NGN4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF25A6NGN4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF25A6NGN4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF25A6NGN4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF25A6NGN4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF25A6NGN4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF25A6NGN4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF25A6NGN4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF25A6NGN4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF25A6NGN4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF25A6NGN4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF25A6NGN4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF25A6NGN4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF25A6NGN4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF25A6NGN4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF25A6NGN4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF25A6NGN4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF25A6NGN4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF25A6NGN4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF25A6NGN4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF25A6NGN4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF25A6NGN4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF25A6NGN4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF25A6NGN4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF25A6NGN4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF25A6NGN4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF25A6NGN4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF25A6NGN4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF25A6NGN4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF25A6NGN4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF25A6NGN4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF25A6NGN4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF25A6NGN4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF25A6NGN4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF25A6NGN4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRAMEF25A6NGN4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF25A6NGN4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRAMEF25A6NGN4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF25A6NGN4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF25A6NGN4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF25A6NGN4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms