Protein–RNA interactions for Protein: A6NCS4

NKX2-6, Homeobox protein Nkx-2.6, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-6A6NCS4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NKX2-6A6NCS4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKX2-6A6NCS4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX2-6A6NCS4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX2-6A6NCS4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX2-6A6NCS4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX2-6A6NCS4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX2-6A6NCS4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX2-6A6NCS4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX2-6A6NCS4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX2-6A6NCS4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX2-6A6NCS4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX2-6A6NCS4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX2-6A6NCS4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX2-6A6NCS4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX2-6A6NCS4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NKX2-6A6NCS4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKX2-6A6NCS4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKX2-6A6NCS4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX2-6A6NCS4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX2-6A6NCS4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX2-6A6NCS4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX2-6A6NCS4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX2-6A6NCS4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX2-6A6NCS4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX2-6A6NCS4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX2-6A6NCS4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX2-6A6NCS4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX2-6A6NCS4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX2-6A6NCS4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX2-6A6NCS4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX2-6A6NCS4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-6A6NCS4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-6A6NCS4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-6A6NCS4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-6A6NCS4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX2-6A6NCS4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX2-6A6NCS4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX2-6A6NCS4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX2-6A6NCS4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX2-6A6NCS4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-6A6NCS4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-6A6NCS4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-6A6NCS4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-6A6NCS4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-6A6NCS4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX2-6A6NCS4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX2-6A6NCS4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX2-6A6NCS4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX2-6A6NCS4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-6A6NCS4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-6A6NCS4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-6A6NCS4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-6A6NCS4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-6A6NCS4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-6A6NCS4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-6A6NCS4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-6A6NCS4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-6A6NCS4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-6A6NCS4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-6A6NCS4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-6A6NCS4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-6A6NCS4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-6A6NCS4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX2-6A6NCS4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX2-6A6NCS4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX2-6A6NCS4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX2-6A6NCS4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX2-6A6NCS4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX2-6A6NCS4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX2-6A6NCS4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX2-6A6NCS4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX2-6A6NCS4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX2-6A6NCS4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX2-6A6NCS4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX2-6A6NCS4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX2-6A6NCS4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX2-6A6NCS4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX2-6A6NCS4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX2-6A6NCS4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX2-6A6NCS4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX2-6A6NCS4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX2-6A6NCS4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX2-6A6NCS4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX2-6A6NCS4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX2-6A6NCS4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX2-6A6NCS4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX2-6A6NCS4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX2-6A6NCS4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX2-6A6NCS4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX2-6A6NCS4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX2-6A6NCS4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX2-6A6NCS4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX2-6A6NCS4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX2-6A6NCS4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX2-6A6NCS4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX2-6A6NCS4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX2-6A6NCS4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX2-6A6NCS4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX2-6A6NCS4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms