Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC66A2RUB6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC66A2RUB6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC66A2RUB6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC66A2RUB6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC66A2RUB6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC66A2RUB6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC66A2RUB6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC66A2RUB6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC66A2RUB6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC66A2RUB6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC66A2RUB6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC66A2RUB6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC66A2RUB6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC66A2RUB6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC66A2RUB6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC66A2RUB6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC66A2RUB6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC66A2RUB6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC66A2RUB6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC66A2RUB6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC66A2RUB6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC66A2RUB6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC66A2RUB6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC66A2RUB6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC66A2RUB6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC66A2RUB6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC66A2RUB6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC66A2RUB6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC66A2RUB6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC66A2RUB6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC66A2RUB6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC66A2RUB6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC66A2RUB6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC66A2RUB6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC66A2RUB6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC66A2RUB6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC66A2RUB6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC66A2RUB6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC66A2RUB6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC66A2RUB6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC66A2RUB6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC66A2RUB6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC66A2RUB6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC66A2RUB6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC66A2RUB6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC66A2RUB6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC66A2RUB6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC66A2RUB6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC66A2RUB6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC66A2RUB6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC66A2RUB6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC66A2RUB6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC66A2RUB6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC66A2RUB6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC66A2RUB6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC66A2RUB6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC66A2RUB6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC66A2RUB6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC66A2RUB6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC66A2RUB6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC66A2RUB6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC66A2RUB6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC66A2RUB6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC66A2RUB6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC66A2RUB6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC66A2RUB6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC66A2RUB6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC66A2RUB6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC66A2RUB6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC66A2RUB6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC66A2RUB6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms