Protein–RNA interactions for Protein: A1A4F0

PQLC2L, Putative uncharacterized protein PQLC2L, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC2LA1A4F0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PQLC2LA1A4F0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PQLC2LA1A4F0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PQLC2LA1A4F0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PQLC2LA1A4F0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PQLC2LA1A4F0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PQLC2LA1A4F0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PQLC2LA1A4F0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PQLC2LA1A4F0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PQLC2LA1A4F0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PQLC2LA1A4F0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PQLC2LA1A4F0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PQLC2LA1A4F0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PQLC2LA1A4F0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PQLC2LA1A4F0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PQLC2LA1A4F0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PQLC2LA1A4F0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PQLC2LA1A4F0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PQLC2LA1A4F0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PQLC2LA1A4F0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PQLC2LA1A4F0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PQLC2LA1A4F0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PQLC2LA1A4F0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PQLC2LA1A4F0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PQLC2LA1A4F0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PQLC2LA1A4F0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PQLC2LA1A4F0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PQLC2LA1A4F0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PQLC2LA1A4F0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PQLC2LA1A4F0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PQLC2LA1A4F0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PQLC2LA1A4F0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PQLC2LA1A4F0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PQLC2LA1A4F0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PQLC2LA1A4F0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PQLC2LA1A4F0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PQLC2LA1A4F0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PQLC2LA1A4F0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PQLC2LA1A4F0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PQLC2LA1A4F0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PQLC2LA1A4F0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PQLC2LA1A4F0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PQLC2LA1A4F0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PQLC2LA1A4F0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PQLC2LA1A4F0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PQLC2LA1A4F0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PQLC2LA1A4F0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PQLC2LA1A4F0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PQLC2LA1A4F0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PQLC2LA1A4F0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PQLC2LA1A4F0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PQLC2LA1A4F0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PQLC2LA1A4F0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PQLC2LA1A4F0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PQLC2LA1A4F0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PQLC2LA1A4F0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PQLC2LA1A4F0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PQLC2LA1A4F0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PQLC2LA1A4F0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PQLC2LA1A4F0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PQLC2LA1A4F0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PQLC2LA1A4F0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PQLC2LA1A4F0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PQLC2LA1A4F0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PQLC2LA1A4F0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PQLC2LA1A4F0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PQLC2LA1A4F0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PQLC2LA1A4F0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PQLC2LA1A4F0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PQLC2LA1A4F0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PQLC2LA1A4F0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PQLC2LA1A4F0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PQLC2LA1A4F0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PQLC2LA1A4F0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PQLC2LA1A4F0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PQLC2LA1A4F0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PQLC2LA1A4F0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PQLC2LA1A4F0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PQLC2LA1A4F0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PQLC2LA1A4F0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PQLC2LA1A4F0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PQLC2LA1A4F0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PQLC2LA1A4F0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PQLC2LA1A4F0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PQLC2LA1A4F0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PQLC2LA1A4F0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PQLC2LA1A4F0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PQLC2LA1A4F0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PQLC2LA1A4F0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PQLC2LA1A4F0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PQLC2LA1A4F0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PQLC2LA1A4F0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PQLC2LA1A4F0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PQLC2LA1A4F0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PQLC2LA1A4F0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PQLC2LA1A4F0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PQLC2LA1A4F0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PQLC2LA1A4F0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PQLC2LA1A4F0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PQLC2LA1A4F0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms