Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
E2F8A0AVK6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
E2F8A0AVK6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
E2F8A0AVK6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
E2F8A0AVK6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
E2F8A0AVK6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
E2F8A0AVK6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
E2F8A0AVK6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
E2F8A0AVK6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
E2F8A0AVK6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
E2F8A0AVK6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
E2F8A0AVK6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
E2F8A0AVK6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
E2F8A0AVK6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
E2F8A0AVK6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
E2F8A0AVK6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
E2F8A0AVK6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
E2F8A0AVK6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
E2F8A0AVK6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
E2F8A0AVK6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
E2F8A0AVK6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
E2F8A0AVK6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
E2F8A0AVK6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
E2F8A0AVK6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
E2F8A0AVK6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
E2F8A0AVK6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
E2F8A0AVK6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
E2F8A0AVK6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
E2F8A0AVK6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
E2F8A0AVK6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
E2F8A0AVK6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
E2F8A0AVK6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
E2F8A0AVK6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
E2F8A0AVK6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
E2F8A0AVK6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
E2F8A0AVK6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
E2F8A0AVK6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
E2F8A0AVK6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
E2F8A0AVK6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
E2F8A0AVK6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
E2F8A0AVK6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
E2F8A0AVK6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
E2F8A0AVK6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
E2F8A0AVK6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
E2F8A0AVK6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
E2F8A0AVK6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
E2F8A0AVK6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
E2F8A0AVK6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
E2F8A0AVK6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
E2F8A0AVK6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
E2F8A0AVK6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E2F8A0AVK6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E2F8A0AVK6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
E2F8A0AVK6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
E2F8A0AVK6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
E2F8A0AVK6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
E2F8A0AVK6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
E2F8A0AVK6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
E2F8A0AVK6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
E2F8A0AVK6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
E2F8A0AVK6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
E2F8A0AVK6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
E2F8A0AVK6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
E2F8A0AVK6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms