Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQV1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A0A0U1RQV1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0U1RQV1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0U1RQV1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0U1RQV1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A0A0U1RQV1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0U1RQV1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0U1RQV1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A0A0U1RQV1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RQV1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RQV1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RQV1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RQV1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RQV1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RQV1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RQV1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A0A0U1RQV1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RQV1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RQV1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RQV1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A0A0U1RQV1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RQV1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RQV1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RQV1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RQV1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A0A0U1RQV1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RQV1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RQV1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RQV1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RQV1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RQV1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RQV1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A0A0U1RQV1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A0A0U1RQV1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RQV1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A0A0U1RQV1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RQV1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RQV1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RQV1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RQV1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RQV1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RQV1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A0A0U1RQV1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0U1RQV1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0U1RQV1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A0A0U1RQV1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0U1RQV1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0U1RQV1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A0U1RQV1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0U1RQV1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0U1RQV1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0U1RQV1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0U1RQV1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0U1RQV1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0U1RQV1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0U1RQV1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A0U1RQV1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0U1RQV1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0U1RQV1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0U1RQV1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0U1RQV1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0U1RQV1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0U1RQV1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0U1RQV1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0U1RQV1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A0U1RQV1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0U1RQV1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0U1RQV1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0U1RQV1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A0U1RQV1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A0A0U1RQV1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A0A0U1RQV1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A0A0U1RQV1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
A0A0U1RQV1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0U1RQV1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0U1RQV1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0U1RQV1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0U1RQV1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0U1RQV1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0U1RQV1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0U1RQV1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0U1RQV1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0U1RQV1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A0U1RQV1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A0U1RQV1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms