Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YY99

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YY99 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
A0A0J9YY99 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
A0A0J9YY99 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
A0A0J9YY99 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
A0A0J9YY99 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
A0A0J9YY99 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
A0A0J9YY99 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
A0A0J9YY99 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
A0A0J9YY99 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
A0A0J9YY99 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
A0A0J9YY99 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
A0A0J9YY99 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A0A0J9YY99 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A0A0J9YY99 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
A0A0J9YY99 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
A0A0J9YY99 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A0A0J9YY99 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
A0A0J9YY99 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
A0A0J9YY99 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A0A0J9YY99 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A0A0J9YY99 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
A0A0J9YY99 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A0A0J9YY99 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A0A0J9YY99 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
A0A0J9YY99 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
A0A0J9YY99 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
A0A0J9YY99 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
A0A0J9YY99 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
A0A0J9YY99 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
A0A0J9YY99 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
A0A0J9YY99 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0J9YY99 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0J9YY99 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0J9YY99 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0J9YY99 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0J9YY99 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0J9YY99 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0J9YY99 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0J9YY99 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0J9YY99 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0J9YY99 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A0A0J9YY99 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
A0A0J9YY99 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
A0A0J9YY99 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0J9YY99 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0J9YY99 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0J9YY99 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0J9YY99 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
A0A0J9YY99 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
A0A0J9YY99 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A0A0J9YY99 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
A0A0J9YY99 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
A0A0J9YY99 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A0A0J9YY99 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
A0A0J9YY99 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A0A0J9YY99 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A0A0J9YY99 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A0A0J9YY99 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
A0A0J9YY99 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A0A0J9YY99 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A0A0J9YY99 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
A0A0J9YY99 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
A0A0J9YY99 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
A0A0J9YY99 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A0A0J9YY99 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A0A0J9YY99 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A0A0J9YY99 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
A0A0J9YY99 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
A0A0J9YY99 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0J9YY99 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0J9YY99 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0J9YY99 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0J9YY99 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0J9YY99 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0J9YY99 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
A0A0J9YY99 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A0A0J9YY99 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
A0A0J9YY99 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
A0A0J9YY99 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A0A0J9YY99 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A0A0J9YY99 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A0A0J9YY99 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A0A0J9YY99 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A0A0J9YY99 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A0A0J9YY99 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A0A0J9YY99 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A0A0J9YY99 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
A0A0J9YY99 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A0A0J9YY99 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A0A0J9YY99 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A0A0J9YY99 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
A0A0J9YY99 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
A0A0J9YY99 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A0A0J9YY99 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A0A0J9YY99 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
A0A0J9YY99 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
A0A0J9YY99 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A0A0J9YY99 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A0A0J9YY99 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A0A0J9YY99 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms