Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DCTN4Q9UJW0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms