Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNTNAP2Q9UHC6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNTNAP2Q9UHC6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms