Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 MTHFR-218ENST00000641909 2254 nt16.26■□□□□ 0.191e-10■■■■■ 200.5
UTP3Q9NQZ2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.961e-6■■■■■ 200.5
UTP3Q9NQZ2 FAM216A-202ENST00000538285 1679 ntTSL 1 (best)20.76■□□□□ 0.911e-6■■■■■ 200.5
UTP3Q9NQZ2 FAM216A-206ENST00000548869 1160 ntTSL 28.56□□□□□ -1.041e-6■■■■■ 200.5
UTP3Q9NQZ2 TUBGCP4-208ENST00000564079 6798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.042e-9■■■■■ 200.3
UTP3Q9NQZ2 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.162e-9■■■■■ 200.3
UTP3Q9NQZ2 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.252e-8■■■■■ 200.3
UTP3Q9NQZ2 AC009120.2-203ENST00000565313 539 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.892e-8■■■■■ 200.3
UTP3Q9NQZ2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.351e-8■■■■■ 200.2
UTP3Q9NQZ2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.579e-7■■■■■ 200.2
UTP3Q9NQZ2 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.099e-7■■■■■ 200.2
UTP3Q9NQZ2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.941e-6■■■■■ 200.2
UTP3Q9NQZ2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.881e-6■■■■■ 200.2
UTP3Q9NQZ2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.861e-6■■■■■ 200.2
UTP3Q9NQZ2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.861e-6■■■■■ 200.2
UTP3Q9NQZ2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.562e-7■■■■■ 200
UTP3Q9NQZ2 WDR27-208ENST00000479310 1289 ntTSL 519.88■□□□□ 0.778e-7■■■■■ 199.9
UTP3Q9NQZ2 SDHAF2-207ENST00000542794 1077 ntTSL 220.55■□□□□ 0.881e-9■■■■■ 199.8
UTP3Q9NQZ2 AP003108.2-202ENST00000541135 580 ntAPPRIS P1 TSL 420.33■□□□□ 0.851e-9■■■■■ 199.8
UTP3Q9NQZ2 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.181e-9■■■■■ 199.8
UTP3Q9NQZ2 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.021e-9■■■■■ 199.8
UTP3Q9NQZ2 AP003108.2-203ENST00000536670 449 ntTSL 59.75□□□□□ -0.851e-9■■■■■ 199.8
UTP3Q9NQZ2 AP003108.2-201ENST00000544025 563 ntTSL 49.59□□□□□ -0.871e-9■■■■■ 199.8
UTP3Q9NQZ2 AP003108.2-208ENST00000543044 883 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.91e-9■■■■■ 199.8
UTP3Q9NQZ2 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.371e-9■■■■■ 199.8
UTP3Q9NQZ2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.576e-7■■■■■ 199.7
UTP3Q9NQZ2 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.486e-7■■■■■ 199.7
UTP3Q9NQZ2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.456e-7■■■■■ 199.7
UTP3Q9NQZ2 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.156e-7■■■■■ 199.7
UTP3Q9NQZ2 PLEC-213ENST00000528025 2115 ntTSL 520.73■□□□□ 0.911e-6■■■■■ 199.7
UTP3Q9NQZ2 MAD1L1-210ENST00000444373 535 ntTSL 416.8■□□□□ 0.282e-7■■■■■ 199.7
UTP3Q9NQZ2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.291e-6■■■■■ 199.7
UTP3Q9NQZ2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.291e-6■■■■■ 199.7
UTP3Q9NQZ2 CLUH-214ENST00000576885 583 ntTSL 315.49■□□□□ 0.078e-8■■■■■ 199.5
UTP3Q9NQZ2 CLUH-204ENST00000571566 545 ntTSL 413.28□□□□□ -0.288e-8■■■■■ 199.5
UTP3Q9NQZ2 BCR-213ENST00000480973 535 ntTSL 417.3■□□□□ 0.369e-7■■■■■ 199.5
UTP3Q9NQZ2 POP1-201ENST00000349693 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.41e-6■■■■■ 199.3
UTP3Q9NQZ2 DNM1-227ENST00000637999 1429 ntTSL 513.15□□□□□ -0.32e-8■■■■■ 199.1
UTP3Q9NQZ2 DNM1-207ENST00000482638 672 ntTSL 59.9□□□□□ -0.822e-8■■■■■ 199.1
UTP3Q9NQZ2 MICAL3-210ENST00000495076 5113 ntTSL 513.32□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 198.9
UTP3Q9NQZ2 GABRG3-204ENST00000554696 774 ntTSL 38.69□□□□□ -1.028e-7■■■■■ 198.8
UTP3Q9NQZ2 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.258e-7■■■■■ 198.8
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC12-220ENST00000482645 1538 ntTSL 221.46■■□□□ 1.035e-8■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.975e-8■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.935e-8■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 ZFAND2A-205ENST00000478137 557 ntTSL 320.66■□□□□ 0.92e-11■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 NUBPL-208ENST00000550649 557 ntTSL 520.29■□□□□ 0.848e-7■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 MFSD12-207ENST00000588626 525 ntTSL 319.19■□□□□ 0.662e-6■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.643e-6■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.613e-6■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 ABCF2-206ENST00000477252 249 ntTSL 318.04■□□□□ 0.482e-11■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 EARS2-211ENST00000564668 627 ntTSL 416.51■□□□□ 0.235e-8■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.151e-8■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 LRRFIP1-210ENST00000474195 1957 ntTSL 215.67■□□□□ 0.15e-8■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.045e-19■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.012e-11■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 AC116366.3-201ENST00000638452 7893 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.02□□□□□ -0.012e-8■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.074e-23■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 TTN-AS1-209ENST00000456053 2033 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 AC098617.1-201ENST00000424116 500 ntTSL 214.03□□□□□ -0.164e-6■■■■■ 198.7
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UTP3Q9NQZ2 SNX1-211ENST00000560829 1869 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.192e-11■■■■■ 198.7
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UTP3Q9NQZ2 LRRFIP1-211ENST00000478958 2869 ntTSL 1 (best)12.09□□□□□ -0.475e-8■■■■■ 198.7
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UTP3Q9NQZ2 EARS2-214ENST00000564987 2870 ntTSL 1 (best)11.98□□□□□ -0.495e-8■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 TTN-AS1-270ENST00000630096 915 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 EARS2-201ENST00000449606 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.595e-8■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 COA1-217ENST00000478504 552 ntTSL 411.17□□□□□ -0.621e-6■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 EARS2-207ENST00000563459 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.675e-8■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 TTN-AS1-262ENST00000626954 864 ntTSL 510.38□□□□□ -0.751e-6■■■■■ 198.7
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UTP3Q9NQZ2 LINC00894-205ENST00000449111 3414 ntTSL 510.11□□□□□ -0.798e-9■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 EARS2-217ENST00000566017 539 ntTSL 49.96□□□□□ -0.825e-8■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 ERMAP-205ENST00000487556 2988 ntTSL 59.91□□□□□ -0.824e-23■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 ERMAP-202ENST00000372514 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.854e-23■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 ERMAP-203ENST00000372517 3423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.854e-23■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 ERMAP-201ENST00000328249 3949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.874e-23■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 POLR2G-207ENST00000531996 660 ntTSL 39.57□□□□□ -0.884e-23■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 TTN-AS1-218ENST00000586452 828 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.911e-6■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 TTN-AS1-239ENST00000590807 728 ntTSL 59.34□□□□□ -0.911e-6■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 SMIM7-201ENST00000358726 850 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.945e-28■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 NUBPL-203ENST00000547839 2001 ntTSL 29□□□□□ -0.978e-7■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 LRRFIP1-206ENST00000464608 564 ntTSL 38.89□□□□□ -0.995e-8■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 AC116366.3-203ENST00000639899 8173 ntTSL 58.84□□□□□ -0.992e-8■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 TTN-AS1-249ENST00000592750 619 ntTSL 58.64□□□□□ -1.031e-6■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.031e-6■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 SMIM7-212ENST00000594507 430 ntTSL 38.6□□□□□ -1.035e-28■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 POLR2G-208ENST00000533442 388 ntTSL 38.59□□□□□ -1.034e-23■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 TTN-AS1-260ENST00000626138 693 ntTSL 58.1□□□□□ -1.111e-6■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 TTN-AS1-257ENST00000625480 633 ntTSL 58.1□□□□□ -1.111e-6■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 TTN-AS1-215ENST00000585451 949 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.121e-6■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 POLR2G-204ENST00000526368 710 ntTSL 27.72□□□□□ -1.174e-23■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 SMIM7-203ENST00000461364 601 ntTSL 27.67□□□□□ -1.185e-28■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 TTN-AS1-258ENST00000625536 693 ntTSL 57.53□□□□□ -1.21e-6■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 AC116366.3-202ENST00000638568 7956 ntAPPRIS ALT2 TSL 57.53□□□□□ -1.22e-8■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 LRRFIP1-214ENST00000489603 531 ntTSL 37.39□□□□□ -1.235e-8■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP42-205ENST00000529406 449 ntTSL 37.16□□□□□ -1.268e-7■■■■■ 198.7
UTP3Q9NQZ2 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.271e-6■■■■■ 198.7
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