Protein–RNA interactions for Protein: Q9HA90

EFCC1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCC1Q9HA90 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCC1Q9HA90 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCC1Q9HA90 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCC1Q9HA90 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCC1Q9HA90 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFCC1Q9HA90 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms