Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA4CQ9C0C4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms