Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NEUROD6Q96NK8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms