Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAX2Q96IS3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAX2Q96IS3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms