Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BCANQ96GW7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCANQ96GW7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms