Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAD50Q92878 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD50Q92878 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms