Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
COPS9Q8WXC6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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COPS9Q8WXC6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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COPS9Q8WXC6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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COPS9Q8WXC6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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COPS9Q8WXC6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
COPS9Q8WXC6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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