Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PIK3C3Q8NEB9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PIK3C3Q8NEB9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms