Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP38Q8NB14 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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