Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSL3Q8N5Y2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms