Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG4DQ86TL0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms