Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPOCD1Q6ZMY3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPOCD1Q6ZMY3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms