Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMBR1LQ6UX01 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms