Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BROXQ5VW32 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BROXQ5VW32 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms