Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms