Protein–RNA interactions for Protein: Q58FG1

HSP90AA4P, Putative heat shock protein HSP 90-alpha A4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AA4PQ58FG1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HSP90AA4PQ58FG1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HSP90AA4PQ58FG1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HSP90AA4PQ58FG1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms