Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TBRG1Q3YBR2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TBRG1Q3YBR2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms