Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UVSSAQ2YD98 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UVSSAQ2YD98 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms