Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL40Q2TBA0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms