Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFE2Q16621 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
NFE2Q16621 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NFE2Q16621 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NFE2Q16621 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NFE2Q16621 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2Q16621 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2Q16621 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2Q16621 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2Q16621 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2Q16621 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2Q16621 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2Q16621 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2Q16621 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2Q16621 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2Q16621 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2Q16621 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2Q16621 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2Q16621 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2Q16621 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2Q16621 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2Q16621 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2Q16621 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2Q16621 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2Q16621 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2Q16621 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2Q16621 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2Q16621 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2Q16621 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2Q16621 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2Q16621 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2Q16621 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2Q16621 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFE2Q16621 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFE2Q16621 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NFE2Q16621 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFE2Q16621 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFE2Q16621 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFE2Q16621 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms