Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECM1Q16610 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM1Q16610 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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