Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTRK3Q16288 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTRK3Q16288 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
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