Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF2Q15853 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF2Q15853 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF2Q15853 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF2Q15853 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF2Q15853 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF2Q15853 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF2Q15853 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF2Q15853 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF2Q15853 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF2Q15853 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF2Q15853 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
USF2Q15853 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF2Q15853 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF2Q15853 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF2Q15853 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF2Q15853 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF2Q15853 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
USF2Q15853 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF2Q15853 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF2Q15853 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF2Q15853 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF2Q15853 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF2Q15853 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF2Q15853 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF2Q15853 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF2Q15853 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF2Q15853 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF2Q15853 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF2Q15853 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
USF2Q15853 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USF2Q15853 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF2Q15853 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USF2Q15853 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF2Q15853 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF2Q15853 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF2Q15853 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF2Q15853 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF2Q15853 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF2Q15853 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF2Q15853 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF2Q15853 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF2Q15853 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF2Q15853 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF2Q15853 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF2Q15853 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF2Q15853 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF2Q15853 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF2Q15853 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF2Q15853 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF2Q15853 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF2Q15853 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF2Q15853 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF2Q15853 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF2Q15853 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF2Q15853 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USF2Q15853 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF2Q15853 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF2Q15853 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF2Q15853 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF2Q15853 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF2Q15853 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USF2Q15853 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USF2Q15853 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USF2Q15853 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USF2Q15853 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USF2Q15853 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USF2Q15853 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USF2Q15853 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USF2Q15853 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USF2Q15853 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USF2Q15853 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USF2Q15853 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USF2Q15853 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USF2Q15853 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USF2Q15853 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USF2Q15853 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USF2Q15853 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USF2Q15853 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USF2Q15853 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USF2Q15853 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USF2Q15853 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USF2Q15853 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USF2Q15853 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USF2Q15853 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USF2Q15853 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USF2Q15853 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USF2Q15853 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USF2Q15853 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USF2Q15853 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USF2Q15853 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USF2Q15853 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USF2Q15853 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USF2Q15853 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USF2Q15853 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USF2Q15853 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USF2Q15853 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USF2Q15853 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USF2Q15853 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USF2Q15853 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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