Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYCP1Q15431 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SYCP1Q15431 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
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