Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CLCA4Q14CN2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CLCA4Q14CN2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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