Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GTF2H2Q13888 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
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