Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL1Q13616 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL1Q13616 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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